+420 220 183 400
Latest publications
Computational metabolomics reveals overlooked chemodiversity of alkaloid scaffolds in Piper fimbriulatum
The Plant Journal 124 (5): e70086 (2025)
Discovery of metabolites prevails amid in-source fragmentation
Y. El Abiead
A. Rutz
S. Zuffa
B. Amer
S. Xing
C. Brungs
R. Schmid
M. S. P. Correia
A. M. Caraballo-Rodriguez
A. Zarrinpar
H. Mannochio-Russo
M. Witting
I. Mohanty
T. Pluskal
W. Bittremieux
R. Knight
A. D. Patterson
J. J. J. van der Hooft
S. Böcker
W. B. Dunn
R. G. Linington
D. S. Wishart
J. Wolfender
O. Fiehn
N. Zamboni
P. C. Dorrestein
Nature Metabolism 2025: Early View
Statistical analysis of feature-based molecular networking results from non-targeted metabolomics data
A. K. Pakkir Shah
A. Walter
F. Ottosson
F. Russo
M. Navarro-Diaz
J. Boldt
J. J. Kalinski
E. E. Kontou
J. Elofson
A. Polyzois
C. González-Marín
S. Farrell
M. R. Aggerbeck
T. Pruksatrakul
N. Chan
Y. Wang
M. Pöchhacker
C. Brungs
B. Cámara
A. M. Caraballo-Rodriguez
A. Cumsille
F. de Oliveira
K. Dührkop
Y. El Abiead
C. Geibel
L. G. Graves
M. Hansen
S. Heuckeroth
S. Knoblauch
A. Kostenko
M. C. M. Kuijpers
K. Mildau
S. Papadopoulos Lambidis
P. W. Portal Gomes
T. Schramm
K. Steuer-Lodd
P. Stincone
S. Tayyab
G. A. Vitale
B. C. Wagner
S. Xing
M. T. Yazzie
S. Zuffa
M. de Kruijff
C. Beemelmanns
H. Link
C. Mayer
J. J. J. van der Hooft
T. Damiani
T. Pluskal
P. Dorrestein
J. Stanstrup
R. Schmid
M. Wang
A. Aron
M. Ernst
D. Petras
Nature Protocols 20: 92–162 (2025)
MassSpecGym: A benchmark for the discovery and identification of molecules
R. Bushuiev
A. Bushuiev
N. F. de Jonge
A. Young
F. Kretschmer
R. Samusevich
J. Heirman
F. Wang
L. Zhang
K. Dührkop
M. Ludwig
N. A. Haupt
A. Kalia
C. Brungs
R. Schmid
R. Greiner
B. Wang
D. S. Wishart
L. Liu
J. Rousu
W. Bittremieux
H. Rost
T. D. Mak
S. Hassoun
F. Huber
J. J. J. van der Hooft
M. A. Stravs
S. Böcker
J. Sivic
T. Pluskal
Conference on Neural Information Processing Systems (NeurIPS) 38: 1-31 (2024)